Soms klikt het gewoon niet tussen medewerkers. Of is er sprake van discriminatie, pesten of seksuele intimidatie. Ook kan een arbeidsgeschil het gevolg zijn van een verschil in inzicht over het functioneren of een verschil in wederzijdse verwachtingen.

Samenwerkingsproblemen kunnen zich voordoen binnen alle lagen en geledingen in een organisatie: tussen werkgever en werknemer en collega's onderling, eveneens tussen directie en bestuur en bijvoorbeeld tussen bestuur en het medezeggenschapsorgaan.